來源:臨床前線
1月20日,管軼教授在接受財新網(wǎng)的采訪后,遭到大量責(zé)罵和攻擊,但不久后,新冠肺炎疫情形勢大變,人們對管軼教授的評價也發(fā)生了巨大改變,大家發(fā)現(xiàn)原來管軼率先對疫情做出的評估和判斷是準(zhǔn)確的。
據(jù)鳳凰網(wǎng)報道,管軼教授在離開武漢后,并沒有因?yàn)楸回?zé)難而退出,他和團(tuán)隊(duì)一直在汕頭大學(xué)和香港大學(xué)聯(lián)合病毒研究所中緊張工作,對新冠病毒及其引發(fā)的疾病進(jìn)行系統(tǒng)研究,幫助當(dāng)?shù)蒯t(yī)院篩查、檢測,優(yōu)化檢測試劑盒與治療方案,并參與對病毒的進(jìn)化與溯源的研究。
剛剛,管軼教授和廣西醫(yī)科大學(xué)胡艷玲教授作為共同通訊作者在預(yù)印網(wǎng)站bioRxiv發(fā)表題為:
Identification of 2019-nCoV related coronaviruses in Malayan pangolins in southern China的*新研究論文。
研究團(tuán)隊(duì)對廣西和廣東反走私行動中查獲的多個穿山甲樣本進(jìn)行檢測,并在穿山甲樣本中發(fā)現(xiàn)了新冠病毒相關(guān)冠狀病毒,屬于此次新冠病毒的兩個亞型,其中一個受體結(jié)合域與新冠病毒密切相關(guān)。
此次發(fā)現(xiàn)穿山甲冠狀病毒的多個譜系及其與新冠病毒的相似性表明,穿山甲應(yīng)被視為此次新型冠狀病毒的可能中間宿主,再次強(qiáng)調(diào)應(yīng)禁止在菜市場等交易穿山甲等野生動物。
這是繼2月6日,華南農(nóng)業(yè)大學(xué)宣布發(fā)現(xiàn)穿山甲為新型冠狀病毒潛在中間宿主后的又一力證,目前華南農(nóng)大的研究結(jié)果尚未發(fā)表,具體研究細(xì)節(jié)還無從知曉。
2019年12月底,湖北武漢出現(xiàn)不明原因肺炎疫情,隨后該疫情擴(kuò)散到中國其他地區(qū)以及亞洲、歐洲、北美、非洲等20多個國家,后證實(shí)該肺炎疫情與一種新型冠狀病毒有關(guān),該冠狀病毒當(dāng)時被臨時稱為2019-nCoV,近日該病毒被正式命名為SARS-CoV-2。
此次新型冠狀病毒導(dǎo)致的肺炎疫情暫時與武漢的華南海鮮市場有關(guān),市場里銷售的野生動物可能是傳染源。
疫情發(fā)生初期,多名確診病例與華南海鮮市場有關(guān),因此市場很快被清理干凈,但并未留取野生動物樣本,因此無法從市場中調(diào)查野生動物的源病毒。
中科院武漢病毒所石正麗團(tuán)隊(duì)在Nature發(fā)表的論文顯示,中華菊頭蝠是*有可能的此次新冠病毒的自然宿主,但尚未在其他其他野生動物中發(fā)現(xiàn)與之密切相關(guān)的冠狀病毒,因此并不清楚將該病毒傳播給人類的中間宿主到底是誰。
穿山甲,是被非法買賣*嚴(yán)重的哺乳動物,它們即被用作食物,又被用作中藥材。因此,管軼團(tuán)隊(duì)從被走私的穿山甲中著手調(diào)查。
管軼團(tuán)隊(duì)收集了2017年8月至2018年1月期間廣西海關(guān)在反走私行動中查獲的18個冷凍穿山甲的(肺,腸,血液)等43個組織樣品。
令人驚訝的是,高通量測序顯示在43個樣本中的六個(兩個肺,兩個腸,一個肺腸混合物,一個血液)存在冠狀病毒。
接下來,研究團(tuán)隊(duì)對2018年5月至7月之間收集的另一批穿山甲樣品進(jìn)行了進(jìn)一步的qPCR檢測。發(fā)現(xiàn)12只穿山甲的19個樣本(九個腸組織,十個肺組織)中,三個肺組織樣本呈冠狀病毒陽性。
然后,管軼團(tuán)隊(duì)聯(lián)系了廣州海關(guān)技術(shù)中心,中心重新檢測了他們在三月份的反走私行動中查獲的五份存檔的穿山甲樣品,這些樣本中同樣發(fā)現(xiàn)了冠狀病毒。
這些在穿山甲中發(fā)現(xiàn)的冠狀病毒的基因組,與新型冠狀病毒(SARS-CoV-2)基因組相似率在85.5%—92.4%,并在系統(tǒng)進(jìn)化樹中代表了新冠病毒的兩個亞型,其中之一(GD/P1L和GD/P2S)與新冠病毒密切相關(guān)。
新型冠狀病毒(SARS-CoV-2)屬于β冠狀病毒屬的Sarbecovirus亞屬,先前已經(jīng)注意到,Sarbecovirus亞屬的冠狀病毒成員經(jīng)歷了廣泛的基因重組。
管軼團(tuán)隊(duì)進(jìn)一步進(jìn)行了重組分析,分析結(jié)果顯示,蝠冠狀病毒ZC45和ZCS21包含多個SARS-CoV相關(guān)譜系(基因組區(qū)域2、5、7)和新冠病毒相關(guān)譜系(包括此次穿山甲中發(fā)現(xiàn)的病毒譜系)的基因組片段(區(qū)域1、3、4、6、8)。
然而,更值得注意的是在穿山甲冠狀病毒、蝙蝠冠狀病毒RaTG13和新冠病毒之間觀察到了推測的重組信號,特別是新冠病毒與廣東穿山甲冠狀病毒的受體結(jié)合域的氨基酸序列相似性高達(dá)97.4%。但蝙蝠冠狀病毒RaTG與新冠病毒的受體結(jié)合域的氨基酸相似度僅為89.2%。
但系統(tǒng)發(fā)育分析表明,廣東穿山甲冠狀病毒并非新冠病毒的*接近親緣關(guān)系。因此,研究團(tuán)隊(duì)推測,廣東穿山甲冠狀病毒與新冠病毒之間的氨基酸相似性可能是由于趨同進(jìn)化而不是重組引起的。
迄今為止,穿山甲是除蝙蝠以外**被新冠病毒相關(guān)冠狀病毒感染的哺乳動物。
在這項(xiàng)研究中,管軼團(tuán)隊(duì)在穿山甲中發(fā)現(xiàn)了兩個冠狀病毒譜系,且它們都與新冠病毒(SARS-CoV-2)相關(guān)。這表明穿山甲極可能是這些冠狀病毒的長期宿主,但這非常令人驚訝,因?yàn)榇┥郊资仟?dú)居動物,且種群數(shù)量非常小,已經(jīng)瀕臨滅絕。
穿山甲種群中的冠狀病毒傳播程度尚需進(jìn)一步調(diào)查,但在廣西和廣東省反復(fù)發(fā)生冠狀病毒感染情況表明,穿山甲是冠狀病毒出現(xiàn)的潛在重要宿主。
注:廣東廣西地區(qū)近年來,發(fā)生了兩次SARS冠狀病毒引起的非典疫情。
包括新型冠狀病毒(SARS-CoV-2)在內(nèi)的多種冠狀病毒,顯然存在于亞洲的許多野生哺乳動物中。盡管穿山甲中冠狀病毒的流行病學(xué),致病性,種間傳染性和可傳播性尚待研究,但這項(xiàng)研究提供的數(shù)據(jù)強(qiáng)烈表明處理這些動物需要相當(dāng)謹(jǐn)慎,應(yīng)嚴(yán)格禁止在菜市場中出售野生動物。
為了了解穿山甲在新型冠狀病毒(SARS-CoV-2)出現(xiàn)中的作用,以及未來人畜共患病傳播的風(fēng)險,需要盡快對中國和東南亞自然環(huán)境中的穿山甲進(jìn)行進(jìn)一步監(jiān)測。
關(guān)于管軼
2003年,管軼團(tuán)隊(duì)率先分離出SARS病毒,并證實(shí)了果子貍是SARS的中間宿主,也是人類感染SARS的直接來源,之后他和鐘南山院士一起上報,廣東開始清除市場上的果子貍,有效遏制了SARS疫情的擴(kuò)散。
2003年底,廣東再次出現(xiàn)SARS疑似病例,管軼提議將該病例送往香港檢測,很快測序結(jié)果證實(shí)為SARS,廣東迅速動員,再次清剿果子貍,此次行動中發(fā)現(xiàn)了5例SARS患者。此后SARS再未出現(xiàn)。
除此之外,管軼團(tuán)隊(duì)還始終在關(guān)注和警惕禽流感,并因“以防控人感染H7N9禽流感為代表的新發(fā)傳染病防治體系長大創(chuàng)新和技術(shù)突破”,管軼與李蘭娟院士、高福院士、袁國勇教授等人一起榮獲2017年度國家科學(xué)技術(shù)進(jìn)步特等獎。
特別提醒:
任何從野外捕獵穿山甲的商業(yè)用途均被禁止。在我國,穿山甲屬于國家二級保護(hù)動物,禁止捕殺和食用,非法捕殺、走私或販賣,可被判監(jiān)5年以上有期徒刑,案情嚴(yán)重*高可判處無期徒刑。
論文鏈接:
https://doi.org/10.1101/2020.02.13.945485
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